とくに片頭痛の治療薬として昔から頻用されている。 頭痛薬が胃に悪い場合にも使用しやすい。（人参湯系） 頭痛の予防にも効果がある。 片頭痛、筋緊張性頭痛、嘔吐、急・慢性胃腸炎、肩こり、頸肩腕症候群、吃逆（キツギャク：しゃっくりのこと） 呉茱萸は桂皮などと同じ散寒薬になっているが、脳に対する作用とかあるらしい。 味がよくないらしく、平気で飲めたら、それだけで合っているとも。 呉茱萸湯が合う方の頭痛は偏頭痛の方が多く、そのとき必ずといってよいほど肩こりを伴う。 その肩こりは、耳の後ろからこめかみの所に表れ、下から差し込んでくるようなもの。 また、呉茱萸湯は胃がもたれ、足が冷たく、のぼせ症で、金時さんのような赤い顏をしている頭痛に効くといわれる。 このような顏色の特徴は、苓桂味甘湯や通脉四逆湯などにみられるように血圧が高かったり、 脳に充血を起こしているときの顔面紅潮や、便秘実熱による瀉心湯証とは異る。